從廈門鐵路建設指揮部了解到，該項目即將轉入樁基施工階段。為了最大程度降低施工噪音對周圍居民，尤其是對高考考生的影響，項目部決定推遲至6月8日夜間起才開始施工，為期3個月。

　　為了保證列車運行安全，樁基施工的時間只能利用白天列車行駛間隙，以及晚上11點10分至次日凌晨5點列車停運的時間來進行施工。盡管施工地點距離周邊住宅區有一定距離，為了盡量減少夜間施工對居民的影響，指揮部表示將盡量減少下半夜的施工時間。

　　另外，站南路作為火車站南側的一條通道，目前仍有公交車、社會車輛通過。但不久之后，站南路也將實行封閉，取而代之的是在工地靠山一側新修建一條道路。樁基施工結束后，下一步將進行火車站周邊5條地下通道的建設和新股道的鋪軌等工程。

　　現在，火車站改擴建處于第一階段，這一階段從去年12月底到2014年2月。在此期間，廈門火車站正常運營。明年春運結束后，廈門火車站將全站封閉，停辦客運。屆時普速列車將過渡到廈門高崎站發車，而動車則過渡至廈門北站發車。